Hvis du har bedt om at be- kræfte sletning af ikonerne, vil Start Menu Cleaner standse op hver gang den finder en ubrugelig ikon, og spørge dig om den skal slettes. Tryk på knappen "Ja" for at slette den, "Nej" for at beholde den. Normalt er der ingen grund til at beholde ubrugelige ikoner.